首个深海甲壳动物深海水虱基因组被中科院海洋所破译！
记者 高雅洁 通讯员 李河昭
日前，中科院海洋所破译了首个深海甲壳动物——深海水虱的基因组，并提醒了深海水虱体型巨大化和深海寡养分环境习惯的共同分子遗传机制。据了解，深海水虱是深海巨型等足类的代表性物种，它们因坚持世界上最长的绝食时刻记载（5年以上）而广受重视。
不同生态位等足类体型结构特征
日前，中科院海洋所李富花研讨员课题组和李新正研讨员课题组协作破译了国际上首个深海甲壳动物——深海水虱（Bathynomus jamesi）的基因组。此研讨是继深海软体动物和深海管虫等深海物种之后，初次报道深海甲壳动物基因组，为提醒甲壳动物共同的深海环境习惯性进化和遗传机制供给了重要分子依据。
深海水虱体型巨大化和养分高效使用相关通路
等足类是甲壳动物中罕见的既包含水生、半陆生和彻底陆生物种，包含深海和浅海物种的类群。不同生态位的类群在体型上存在巨大差异，其间，深海等足类呈现出体型巨大化现象。理论上讲，深海环境极端恶劣，其寡养分环境不利于巨型生物的生计，因其需求更多的肯定能量。深海水虱是深海巨型等足类的代表性物种，它们因坚持世界上最长的绝食时刻记载（5年以上）而广受重视。深海水虱基因组的破译为提醒巨型甲壳动物习惯深海寡养分环境的共同分子机制供给了重要根底。
研讨人员首要完成了深海水虱基因组的测序和拼装，构建了高质量的基因组图谱，其基因组拼装巨细达5.89 Gb，是现在已测序甲壳动物中基因组最大的物种。研讨发现其基因组中转座元件的含量高达84%，是引起基因组扩张的重要原因。经过比较基因组学剖析，研讨人员发现深海水虱基因组内多条成长相关信号通路上的基因发生了明显扩张，包含两条激素信号通路（thyroid and insulin hormone signaling），mTOR信号通路和Hippo 信号通路，阐明深海水虱体型巨大化的构成或许与其强化的成长相关信号通路密切相关。
深海水虱具有一个被填满食物的巨大的胃，占身体体积的2/3，还具有兴旺的用于存储有机物质的安排——脂质体。为了解析深海水虱养分高效使用机制，研讨人员对深海水虱不同安排进行了转录组测序和剖析，成果发现很多糖代谢和膜泡运送相关的基因宗族在深海水虱基因组上发生了明显扩张，且特异性地在胃和肠道中高表达，提示其或许与能量的高效使用相关。此外，研讨人员发现脂质体内脂质的堆集首要得益于其较低的脂质代谢功率，而非高效的脂质组成才能。
相关研讨成果 《Genome of a giant isopod, Bathynomus jamesi, provides insights into body size evolution and adaptation to deepsea environment》宣布在生物学Top期刊《BMC Biology》上。
论文链接：
https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-022-01302-6
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